La Direction du Contrôle, Suivi et de l’Evaluation (DCSE) est chargée de :

• assurer le contrôle et le suivi de l'action gouvernementale, et évaluer les résultats;
• assurer le suivi et l'évaluation de la mise en oeuvre du Plan National de Développement, en partenariat avec les Ministères sectoriels, les Partenaires au Développement, les Comités de Districts de suivi, le secteur privé et la Société Civile ; 
• assurer la mise en œuvre de la Politique nationale de l'évaluation et de son plan d'actions ;
• assurer la conception et la mise en œuvre d'un système d'information, de suivi et d'évaluation des politiques publiques, projets et programmes en lien avec les objectifs de développement ;
• appuyer les départements ministériels dans l'évaluation des politiques, des plans et des programmes de développement ;
• développer et vulgariser de nouvelles méthodes et approches en matière de suivi et d'évaluation des politiques publiques.

La Direction du Contrôle, du Suivi et de l’Evaluation comprend deux (2) Sous-Directions :

• la Sous-Direction du Contrôle et du Suivi ;
• la Sous-Direction de l'Evaluation.

Les Sous-directions sont dirigées par des Sous-directeurs nommés par arrêté du Ministre. Ils ont rang de Sous-directeur d'Administration Centrale.